Въпреки че ядреният референдум мина вяло, успя да роди множество парадокси, които ЦИК не може да обясни.

Днес стана ясно, че подписите на гласувалите в цялата страна надвишават с 10 000 броя на бюлетините. Досега подобно драстично разминаване не се е случвало на нито едни избори при далеч по-висока избирателна активност. ЦИК обясни случая с небрежната работа в някои секционни комисии. Това обаче поставя още по-силно под въпрос честността на предстоящите парламентарни избори, съобщава в."Сега" в утрешния си брой. По данни на ЦИК в списъците за гласуване са се подписали 1 415 183 избиратели, а в урните има 1 405 463 плика, т.е. подписите са с 9720 повече. Което означава, че близо 10 000 българи са се подписали, че са гласували, но техните гласове липсват. Това е най-драстичното разминаване между подписи и бюлетини досега. На парламентарните избори през 2005 г. са отчетени 29 бюлетини повече от подписите за цялата страна. През 2001 г. подписите са със 154 повече. Сериозно разминаване има през 2009 г. - над 20 хил., но тогава разликата се дължеше на факта, че се гласуваше за мажоритарни кандидати и за пропорционални листи и много бюлетини бяха обявени за невалидни. Днес депутати сигнализираха, че в секции в няколко изборни района в страната, включително и в София, са отчетени повече бюлетини, отколкото са подписите на гласувалите. Опитвайки се да замаже гафа, ЦИК не само не отрекъл пред "Сега" този факт, но и посочил данни за обратната тенденция - повече подписи, отколкото бюлетини.

Говорителят на ЦИК Бисер Троянов даде фрапиращ пример със секция в софийския квартал Чепинци, в която при 103 подадени бюлетини в протокола имало само два подписа. "Действително се създава впечатление, че двама души са гласували със 103 бюлетини", призна Траянов. Но отдаде случая на небрежност от страна на избирателите, които са напуснали секцията, без да се подпишат. Не стана ясно как гражданите са били допуснати да си вземат личната карта, без да подпишат протокола, че са гласували. Говорителят на ЦИК допуснал също, че членовете на СИК може да не са отразили правилно в протоколите броя на положените подписи. Или дори да са вписали там произволно число. "Това се дължи най-вече на пропуски на СИК при съставянето на изборните протоколи", смята той. На въпрос какъв би бил мотивът им да го направят Траянов лаконично отговорил: "Трябва тях да питате за това".