Флин основава продуцентската компания "Метрополитън филмс" през 1997 г. заедно със съпругата си Хуанита Уилсън. Сред продуцираните чрез компанията му заглавия са "Последният дуел" на Ридли Скот с Мат Деймън и Адам Драйвър, хитовите романтични комедии "P.S. Обичам те!" с Хилари Суонк и Джерард Бътлър, и "С любов, Роузи" с Лили Джеймс и Сам Клафлин.
Джеймс Флин е съпродуцент на филма "Баншите от Инишерин" на Мартин Макдона, номиниран за девет "Оскар"-а и десет награди БАФТА.
Компания "Метрополитън филмс" е работила над повече от 80 филмови и телевизионни продукции. Сред сериалите, които е продуцирала, са "Династията на Тюдорите", "Борджиите" и "Викинги".
"Всички ние в "Метрополитън филмс" сме дълбоко натъжени от кончината на нашия уважаван основател, колега и голям приятел Джеймс Флин. Няма думи, които да опишат адекватно огромния принос на Джеймс към ирландската филмова и телевизионна индустрия в продължение на три десетилетия, както на национално, така и на международно ниво. Той с готовност и щедрост даваше своите съвети и напътствия на всички, които ги търсеха - от млади начинаещи режисьори до утвърдени ирландски и международни професионалисти в бранша. Джеймс се бори с неотдавнашното си заболяване със смелост, достойнство и позитивизъм до самия край. Поради тази причина ние ясно осъзнаваме, че новината за кончината му беше неочакван шок за всички ни", се посочва в изявлението, направено от продуцентската компания.