51-годишният Вагнер спечели промоция за Висшата лига с Хъдърсфийлд през 2017 и запази мястото на отбора в елита през следващия сезон. Германцът бе освободен през януари 2019 и пое Шалке, където стана значима част от серия от 18 мача без победа.
След като напусна Гелзенкирхен, Вагнер бе свързван със завръщане в Англия, но вместо това той пое швейцарския Йънг Бойс през 2021. Въпреки че вкара отбора в групите на Шампионската лига и победи Манчестър Юнайтед, германецът бе уволнен през 2022 заради незадоволително представяне в швейцарското първенство.
В Норич, Вагнер ще работи отново със спортния директор Стюърт Уебър, с който си партнира и в Хъдърсфийлд.