Проф. Панайотов е отличен с решение на Академичния съвет по предложение на Факултета по химия и фармация на Софийския университет за големите му заслуги към факултета.
Заместник-ректорът на Алма матер доц. д-р Георги Вълчев се обърна към присъстващите и заяви, че за него е огромна чест да изпълни решението на Академичния съвет на СУ. От свое име, от името на ректорското ръководство и на цялата академична общност на Софийския университет, той изрази благодарност към проф. Панайотов за неговата работа. "Няма как човек с подобни заслуги като Вас да не е оставил диря в университета и предложението на Факултета по химия и фармация срещна единодушната подкрепа на Академичния съвет", каза доц. Вълчев. Той допълни, че високо се оценява всичко онова, което извън преките си служебни задължения, проф. Панайотов е дал на Алма матер и на българското образование.
Деканът на Факултета по химия и фармация чл.-кор. проф. Тони Спасов заяви, че поводът да се съберат е повече от радостен. Той припомни, че проф. Панайотов е създал научно направление, научна група, която и в момента е активна, компактна и дава пример във факултета за обединени усилия в една важна, трудна научна област, каквато е физикохимията. Деканът подчерта, че изключително важно е и неговото участие в административната дейност на университета - не само като декан в продължение на четири години, но и извън факултета. Проф. Спасов припомни и работата на проф. Панайотов в Националната агенция за оценяване и акредитация (НАОА), и особено за акредитирането на висшите училища в България. Проф. Панайотов е първият председател на агенцията, успял да изгради критерии за оценяване, които дълго време работят изключително успешно.
Проф. Спасов обърна внимание и на работата на проф. Панайотов, насочена към разбирането на общността в България за това, че в направлението "Фармация" факултетът може да обучава с необходимото качество и има изследователски и образователен капацитет.
От името на целия факултет деканът благодари на проф. Панайотов за поддържането на изключително важен баланс между наука и преподаване, между ангажираност и висока научна активност към общите дела на факултета и университета. "Искам да благодаря за Вашата отдаденост и за това, че изградихме изключително честни отношения, на които винаги съм разчитал", каза проф. Спасов.
Проф. Панайотов благодари сърдечно за това отличие и посочи, че с годините чувството, че е част от Софийския университет, се засилва и човек разбира, че университетът е може би най-важното нещо, което му се е случило. "134 години на нашия университет са малък срок в сравнение със столетията на европейските университети, но това е израз на историческата съдба на България, а не на някакви нейни слабости. Тъкмо наопаки - бащите на нашия университет - нашите предшественици, правилно са формулирали задачите на университета, използвайки най-добрите модели на европейските университети по онова време. Лаборатории и школи в СУ се появяват много бързо и започват да работят в контакт със световната наука ", посочи проф. Панайотов. Той добави, че тази първоначална скорост, с която университетът се насочва към световната наука, е била забелязана веднага от четиримата нобелисти в областта на природните науки, които присъстват на 50-годишния юбилей на Софийския университет през 1939 г.
Според проф. Панайотов Софийският университет правилно е насочил потенциала си към важни научни и университетски проблеми в областта на новите микро- и наноструктури и материали, както и науките за живота - медицина и фармация. В словото си той проследи темата за отношенията между университета и университетските хора, от една страна, и властите, религиозни и светски, от друга. По думите му това са отношения, които често пъти са много трудни, но днес виждаме развитие, което обещава хармонично съчетаване на възможностите на университетите и държавата. Проф. Панайотов посочи, че темата е много голяма, и в изказването си акцентира върху две отминали епохи - века на възхода, на появата на модерната наука - XVII век, и бурното десетилетие на Френската революция - на границата между XVIII и XIX век.
Проф. Иван Панайотов е уважаван учен и преподавател от Факултета по химия и фармация, основател на биофизикохимичното направление в Катедрата по физикохимия и ръководител на много дипломанти и докторанти в това направление. Днес те са уважавани професори, доценти и асистенти във Факултета по химия и фармация, в Медицинския факултет и в Българската академия на науките. Проф. Иван Панайотов е бил декан на Факултета по химия и фармация и дългогодишен председател на НАОА. Научната дейност в основаното и развито от проф. Панайотов направление е получила широко признание в международната специализирана литература, подчертават от СУ.