В писмото си до Вартоломей той посочва, че „в този важен период, навременните решения на Вселенската патриаршия могат да повлияят решаващо върху духовната идентичност на настоящите и бъдещите поколения, а оттам и върху духовната и социална среда в Република Северна Македония”.
Пендаровски пише, че искрено се надява и очаква скорошно окончателно уреждане на административния статут на църквата в страната, чрез издаване на томос за автокефалия от страна на Вселенската патриаршия.
„Пълното завършване на автокефалията на нашата църква е от върховен национален интерес за нас, защото открива възможност за ново и необременено духовно израстване на Охридската архиепископия и напредък и помирение в македонското общество”, пише Пендаровски.