Сградата е с национално значение и е тясно свързана с важни събития от българската история. Поради дългогодишно неизползване обаче тя е в силно увредено състояние, което налага конструктивно укрепване и цялостна реставрация. Проектът предвижда пълно конструктивно възстановяване, укрепване и реновиране на конака. Консервационно-реставрационните дейности, както и вътрешното разпределение на помещенията ще бъдат съобразени с бъдещите експозиционни функции на музея. Планирано е оформянето на отворени и просторни пространства, разположени на два етажа, включващи експозиционни зали и обслужващи зони за посетители и служители.
Ще бъдат подменени изцяло амортизираните инсталации чрез внедряване на съвременни системи за отопление, климатизация, вентилация и сигурност. Предвидено е и осигуряване на достъпна среда за хора в неравностойно положение. Обновяването ще обхване и прилежащото пространство около сградата – площада, стълбищата и зелените площи.
Проектът за новия музей в Мелник се финансира със средства от Програма „Развитие на регионите“ 2021–2027 чрез прилагане на подхода „интегрирани териториални инвестиции“, както и с целеви средства от държавния бюджет. С реализирането му конакът ще бъде социализиран като съвременен музей и притегателен културен център, който ще допринася за обогатяването на духовния живот в Мелник и региона и за съхраняването и популяризирането на богатото историческо наследство на района.
През ноември беше съобщено, че Община Петрич в партньорство с Община Сандански започва реализирането на мащабен проект „Интегрирани инвестиции за подобряване на свързаността, туристическия потенциал, социално-икономическото и културно развитие на южната част на Югозападния район за планиране“ по процедура „Концепции за интегрирани териториални инвестиции“. Концепцията включва проекти, които ще бъдат изпълнявани в рамките на шест оперативни програми. Предвидено е обновяване на пътната настилка в Мелник.